我院药剂科组建于1934年，是集药学服务、科研、教学和管理为一体的科室，目前下设药库、门急诊药房、中药房、中心药房、静脉药物配置中心、临床药学室、红谷滩门诊中西药房、北院药房、眼科药房、颗粒剂药房、九龙湖药房、血药浓度监测室等部门。为提升患者的就诊体验，我院药剂科积极引进全自动单剂量摆药机及中药颗粒剂等设备优化发药流程，设立门诊用药咨询窗口，解答患者用药疑惑，减少药品不良事件发生风险。我院药剂科重视临床药学学科发展和临床药学服务工作，目前共有6名专职临床药师，分别涵盖呼吸、肿瘤、ICU、内分泌、心内、神经内科6个临床专科（或专业）。主要参与药学查房、药学监护及会诊、药物不良反应上报、药物浓度监测、用药教育、医院合理用药管理、科研和教学等工作。围绕以患者为中心的服务理念，以“准确、高效、专业、优质”为服务目标，为临床及广大患者提供优质、安全、合格的药品，提供个体化的临床药学服务。
科室共有正高主任药师1名，副主任药师3名，主管药师47名，研究生学历21人，江西省优秀药师称号6人，培训江西省审方药师17人。2012年获批国家卫健委临床药师培训基地，拥有国家卫健委临床药师培训基地负责人1名，赣南医学院兼职教授、入选江西省赣鄱人才库1名，带教师资4人，为各级医疗机构培养通科临床药师27人，同时为南昌大学、赣南医学院、湖南医学院、江西省中医药高专、抚州医学院、南昌医学院等大中专院校带教实习生200余人。
药剂科与南昌市心血管病精准防治重点实验室开展多组学实验研究。开展治疗药物监测，已开展抗癫痫药物等药物的血药浓度监测，为个体化用药提供指导。
药剂科近三年参与的各项比赛屡创佳绩，2020年荣获江西省药品不良反应监测先进单位、全国医药经济信息网信息工作先进单位等荣誉；2021年荣获第七届MKM中国药师职业技能大赛奖全国总冠军并荣获“优秀组织单位奖”、药学服务经典案例江西区域评选大赛一等奖；2021年江西省药品不良反应监测工作先进单位；荣获第六届中国临床合理用药大会三等奖；第十一届治疗药物监测学术年会优秀壁报奖；2021年度江西省临床药师高峰论坛优秀论文一、二等奖；2022年药立方抗感染案例江西赛区一等奖、荣获全国“药学服务优秀案例”；2022年健康进万家科普比赛获江西总决赛二等奖，入围健康促进公益行星药师科普行动Top20，获优秀星药师团队及科普之星称号；2022年 ACCP名古屋药学大会最佳壁报奖；2022年江西省临床药师高峰论坛优秀论文二等奖、优秀奖。2023年药学服务经典案例江西区域评选二等奖。共承担省部级项目和市厅级项目20余项，发表SCI论文6余篇，中文核心论文10余篇，国家级论文30余篇。
药剂科将立足科室发展，以“人才兴科、服务立科、品质建科、科教强科”的目标，科学规范管理好药品，坚持不断提升临床药学服务水平，协助临床为患者提供“量体裁衣”式的个体化给药服务，为保障患者用药疗效和安全贡献药学力量。